O sistema de preferências de FreeCAD está localizado no menu Editar → Preferências.
A funcionalidade FreeCAD esta dividida em diferentes módulos, sendo cada módulo responsável pelo funcionamento de um específico bancada. FreeCAD também usa um conceito chamado de carregamento atrasado, o que significa que os componentes são carregados somente quando eles são necessários. Você deve ter notado que quando você selecciona uma bancada na barra de ferramentas FreeCAD, que bancada e todos os seus componentes são carregados no momento. Isso inclui suas configurações de preferências.
Sem qualquer módulo carregado, você terá acesso a duas secções de configuração, responsáveis das configurações gerais do aplicativo e das configurações de visualização.
Quando começar a FreeCAD sem bancada carregada, vai ter uma janela de preferências mínima. Quando carregar módulos adicionais, aparecerão novas secções na janela de preferências, o que lhe permite configurar os detalhes de cada bancada.
FreeCAD está sempre em constante evolução, logo os conteúdos dessas ecrãs podem diferir das imagens anteriores. As configurações são geralmente auto-explicativas, logo não deve ter dificuldades para a configuração do FreeCAD segundo necessidades.
O módulo rascunho tem a sua preferences ecrã.